U slučaju prekomjernog rasta bakterija u tankom crijevu (SIBO), važno je prilagoditi svoju ishranu posebno kako biste spriječili daljnje “hranjenje” bakterija. Dijeta s niskim sadržajem FODMAP-a je posebno korisna, jer izbjegava fermentirajuće šećere koji se lako metaboliziraju od strane bakterija u tankom crijevu. Posebna dijeta sa ugljikohidratima (SCD) ili elementarna dijeta također može biti podrška. Dugoročno, prehranu treba individualno prilagoditi kako bi se izbjegao nedostatak nutrijenata i stabilizirala crijevna flora. Preporučljivo je konsultovati se sa iskusnim nutricionistom ili naturopatom.